История самого молодого объединения ВМФ началась в 1920 году на берегу Цемесской бухты. К началу Великой Отечественной войны база состояла из соединения кораблей охраны водного района, отряда торпедных катеров, дивизиона подводных лодок, береговой артиллерии и службы обеспечения. Они служили на защите окруженных Севастополя и Одессы. А после освобождения Новороссийска еще одной задачей ВМБ стала очистка акватории от боеприпасов.

В 1947 году Новороссийскую ВМБ расформировали, однако после распада СССР взялись за ее возрождение. 8 сентября 1994 было подписано Постановление Правительства РФ о формировании Новороссийской военно-морской базы в составе Черноморского флота. И уже через два года вышел приказ, устанавливающий официальный ежегодный праздник.